医保定点药店药价普遍高于普通药店的现象一直存在。上述业内人士认为，这一现象正是源于医保政策不放开导致的变相垄断。2007年，武汉媒体的一次调查，开启了对这一现象的揭露和探讨，此后类似的问题亦开始在各地媒体上纷纷曝光。

　　2008年，南京一位身患高血压病多年的市民就向当地媒体反映，其一直都在自家附近一家医保定点药店刷卡购买珍菊降压片，价格14.8元，但一次逛街时却在某平价药店发现同规格、同厂家的珍菊降压片只卖7.4元，价格整整低了一半;而他老伴儿吃的倍他乐克，医保定点药店价格也比平价药店高出了三成。

　　2009年5月26日，央视焦点访谈栏目专门制作了一期名为《定点药店药价缘何高》的节目，对上海医保定点药店药价高的现象进行了报道。节目中，据上海患者徐霖兴老人的调查，上海部分医保定点药店的药价要比普通药店贵30%～50%，而有的药品还不止这个数。为此，焦点访谈呼吁增加医保定点药店的数量，尤其要增加平价药店在医保定点药店中的比例。

　　似乎作为对这一呼吁的“反应”，2009年年底，上海市新增了58家医保定点药店，医保定点药店总数达到了333家。而且其中给予“平价药店”特别优待，即新增平价药店不受医保定点药店距离间隔限制。在这次新增的医保定点药店中，有平价药店14家，约占此类申报药店总数的80%，占新增医保定点药店总数的24%。

　　但是据了解，这次新增医保定点药店是上海市审批医保定点药店的第十一批。而此后至今，上海医保定点药店的数量一直维持在333家，没再进行过新的审批。

　　2010年11月，上海市人力资源和社会保障局、上海市医疗保险办公室颁布新的《上海市基本医疗保险定点零售药店审批办法》(以下简称《办法》)，《办法》自2011年1月1日起施行，至2015年12月31日截止。与之前的《上海市城镇职工基本医疗保险定点零售药店管理暂行办法》(以下简称《暂行办法》)相比，上海市对医保定点药店进行总量控制的思路并没改变。

　　《办法》规定：上海市人力资源和社会保障局(市医疗保险办公室)根据本市药品零售业规划、城镇职工基本医疗需求、医疗保险基金支付能力，以及医疗保险计算机网络容量等，制定本市医保定点零售药店总体规划，并根据总体规划，对医保定点零售药店数量实行总量控制。同时，上海市人力资源和社会保障局(市医疗保险办公室)根据医保定点零售药店的服务质量、费用、效率、服务人群以及服务需求变化等，对医保定点零售药店总量进行调整。

　　此外，与成都的“即时审批”完全不同的是，《办法》规定，上海市对医保定点零售药店采用不定期审批的方式，具体接受申请和开展审批工作的日期，则以书面形式公布。