引入商业保险的做法一度引发争议，以至于邓飞在各个场合都要解释一番。
“每一个人面对医院都弱势，导入商业保险公司，能为我们博弈医院。”邓飞说，商业保险公司能有效地降低医疗成本，同时，如果保费精算合理，能够确保保险公司在微利或低利下运行，借助保险公司的专业风险管理能力，能够提高项目运作效率。
启动
“大病医保”一呼百应。
2月18日，一个来自五常龙凤山乡学田村的农民在微博上卖大米，他声称，每购买一份，他就捐赠5元给“大病医保”项目。可当时“大病医保”还没开通捐款账户，官方微博只得回应道：感谢，建议将善款转捐给“免费午餐”。
未几，知名企业家史玉柱为“大病医保”捐赠了200万元的启动资金，复地集团长期提供免房租办公室，百度公司捐赠官网服务器，神州租车提供工作用车，清华大学合心公益团队则捐建官方网站……早在项目正式启动之前，来自企业的资源就已源源不断地进入。
政府部门也乐于为“大病医保”添柴加火。3月3日，36位核心发起人之一，CCTV新闻主播张泉灵就儿童大病问题专访卫生部部长陈竺，陈竺答道：“欢迎邓飞等人联系农保司，共同推进农村儿童大病医保。”同时，陈竺透露，今年“新农合”也会拿部分钱来投商业保险。当张泉灵把陈竺的答复告知邓飞时，邓飞兴奋地说：“大好消息！”
经过半年多筹划，7月18日，“大病医保”公益基金在北京正式启动。湖北省鹤峰县被选为“大病医保”首个试点地区，当地22232名乡村儿童收到了这样一份比“免费午餐”更给力的“大礼”。邓飞介绍，“大病医保”公益基金将每年投入167万元，为鹤峰6至16周岁儿童购买保费，每人每年75元。
按协议，在家长为患病的儿童所花的医治费用超过5000元时，大病保险就会进入实时报销，且不受医疗地域限制。自付医治费用在10万元以下（含10万元），商业保险报销比例为90%；如超过10万元、低于20万元，报销比例则为100%，最高赔付额20万元。
王振耀认为，大病医保项目是一次医疗领域的重大变革，“大病医保项目带来的影响远远超过免费午餐”，它不仅影响中国的3亿多儿童，甚至可能会影响到中国的医疗体制改革。
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