我国现行的支付方式是按项目付费，而对这种方式引发过度医疗弊端的认识已基本形成共识。而"十二五"规划当中提出未来支付方式的改革方向，则包括按病种付费、按人头付费、总额预付等。
顾昕认为，从按项目付费制到复合型的打包付费制，即门诊统筹以按人头付费为主，住院则是按病种付费为主，这是大趋势。
人社部、卫生部也先后下发过文件，推行支付方式的改革。包括北京、上海等公立医院改革的试点城市，已经相继开展了按病种付费、总额预付等支付方式改革的探索。
北京市卫生局巡视员邓小虹介绍，从2011年7月至今年五月底，来自北京6家试点医院的按病种分组付费病例共16039例，涉及病种106个（试点总共108个），医疗成本支出下降了18%。
可以看到，支付方式的改变一定程度上控制了医疗费用的支出。但值得注意的是，北京超过大半年的试点推进，仅有1.6万个病例。实际能够产生多大的效果，还需要未来更多的数据来进一步评估。
目前，各地关于医保支付方式改革的探索都在起步阶段，除缺乏更为充分的数据外，现行政策也存在弊端。
除按项目付费产生过度医疗的弊端外，邓小虹还指出，发改委对药品、服务项目的行政定价严重与成本背离，使医疗只追求高利润项目；而有关药品的加成管制政策，则导致药品价格居高不下等等。
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