省政协在报告中指出，广东各市医疗保障信息系统基本建成，实现区域内医疗费用即时结算。同时，公共卫生信息化有新突破，传染病与突发公共卫生事件信息报告管理系统和突发公共卫生事件应急指挥系统基本建成。省政协指出，目前，广东医药卫生信息化尚未形成体系，顶层设计亟待加强。
信息化建设各自为政，没有形成相互衔接的医药卫生信息化体系，各类专业化的业务管理信息体系，如便捷化的医疗服务信息体系、普及化的健康管理信息体系、规范化的信息标准体系、共享化的信息数据体系、高效化的信息技术支撑体系等，需要系统化、集成化。在视察中发现，由于没有统一的标准，有些市和医疗单位担心信息不能兼容，会造成资源浪费而不敢投入。
医疗、医药、医保还没有形成“三医”信息共享。组织机构建设滞后，专业技术人员匮乏也是广东医药信息化建设的难题，各级卫生机构信息管理部门的定位和职责定义不清，专业人员编制偏少。
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