一、参保范围不同
城镇职工医疗保险的参保范围是城镇用人单位及其职工和参加了基本养老保险的灵活就业人员；城镇居民医疗保险的参保范围是不属于城镇职工基本医疗保险制度覆盖范围的所有城镇居民。
二、缴费标准不同
城镇职工基本医疗保险费由用人单位和职工共同缴纳。在职职工按本人工资总额的2%缴纳，用人单位按在职职工工资总额的7.5%缴纳。退休人员本人不缴费，原用人单位按退休人员退休（养老）金总额的5%缴纳。灵活就业人员由本人按上年度全市在岗职工平均工资的8%缴纳。
城镇居民基本医疗保险费由个人缴费和政府补助构成，筹资水平根据全市上年度城镇居民人均可支配收入的一定比例确定。其中：在校学生和未满18周岁非在校少年儿童每人每年的筹资水平为全市上年度城镇居民人均可支配收入的1%左右；其他非从业城镇居民的筹资水平为全市上年度城镇居民人均可支配收入的2%左右。今年，我市城镇居民基本医疗保险费的筹资标准为学生儿童120元/年、成年居民300元/年，其中个人缴费为学生儿童30元/年、成年居民210元/年，政府对参保居民的补助为90元/年。对于参保的低保对象、重度残疾人（一、二级）、低收入家庭60岁以上老年人以及三无人员，政府还有额外补助。
三、缴费年限不同
城镇职工医保退休后个人不在缴费，但灵活就业人员的最低缴费年限为15年，退休时不够15年的要一次性补够15年，才能享受退休职工医疗待遇。
城镇居民医保终生缴费，才能终生享受。
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